Основные задачи Бухгалтерии: 
- Ведение бухгалтерского учета, контроль за рациональным и целевым использованием материальных и финансовых ресурсов, обеспечение сохранности собственности Академии.

- Формирование полной и достоверной информации о деятельности Академии и ее имущественном положении - руководителям, учредителям, участникам и собственникам имущества Академии.

- Обеспечение информацией, необходимой внутренним и внешним пользователям бухгалтерской отчетности для контроля за соблюдением законодательства РК при осуществлении организацией хозяйственных операций и их целесообразностью, наличием и движением имущества, использованием материальных, трудовых и финансовых ресурсов в соответствии с утвержденными нормами, сметами.

- Предотвращение отрицательных результатов хозяйственной деятельности Академии и выявление внутрихозяйственных резервов обеспечения ее финансовой устойчивости.

- Организационно-методическое руководство, координация и контроль деятельности структурных подразделений Академии по вопросам финансового контроля и бухгалтерского учета.

- Подготовка и представление руководству информационно-аналитических материалов о состоянии и перспективах развития бухгалтерского учета в Академии

- Совершенствование и внедрение новых методов организации работ с использованием современных информационных технологий.

- Бухгалтерия осуществляет свою деятельность во взаимодействии с другими службами и структурными подразделениями Академии, а также в пределах своей компетенции со сторонними организациями.

- За ненадлежащее исполнение должностных обязанностей и нарушение трудовой дисциплины работники бухгалтерии несут ответственность в порядке, предусмотренный действующим законодательством.

- Участие в пределах своей компетенции в подготовке и исполнении управленческих решений руководства Академии.